También es recordado como seleccionado nacional, aunque no con tanta fortuna. Integró el plantel olímpico de Atenas 2004 que quedó eliminado en fase de grupos por Mali y Corea del Sur. Dos años después, en la Copa del Mundo de Alemania, se fue expulsado en el partido que México perdió 1-2 contra Portugal.

En términos generales tuvo una carrera prolífica, a la que decidió ponerle fin en 2016 con Rayados como su último equipo profesional. Vistió además las camisetas de Chivas, Querétaro y Chiapas, donde pasó sin pena ni gloria.

Una vez retirado de las canchas, Pérez partió a Europa para prepararse como director técnico. Hizo sus estudios de UEFA Pro en España, país donde pudo dirigir al Toledo de la tercera división tras haber concluido su curso de entrenador de la Real Federación Española.

En agosto de 2020, Gerardo Torrado, director general deportivo de la Federación Mexicana de Futbol, lo anunció como nuevo responsable del banquillo Sub 17, cargo que dejó vacante Marco Antonio Ruiz para incorporarse a Tigres como auxiliar de Ricardo Ferretti.

En este partido tuvo lugar una imagen completamente histórica, que protagonizaron Luis Ernesto Pérez y Walter Gaitán. Ambos referentes se cruzaron en una jugada que siempre levantó rumores: ¿qué se dijeron? O más bien, ¿qué no se dijeron?

En entrevista paraRG La Deportiva, Lucho recordó la jugada al señalar: “Lo del grito a Walter Gaitan fue parte del fútbol, le dije que así debía ser, el persiguiéndome y en el piso, con otras otras palabras”. No cabe ninguna duda de que los Clásicos entre los de Monterrey se juega al 100%.

Hace algunos años, en diálogo con Mediotiempo, había aclarado sobre el mismo hecho: “Le robo el balón y me caí.Cuando me estoy levantando justo sale esa foto. Le dije: ´pero la recon%#&de tu madre´. Nos reputeamos de la madre, de todo”.

Justamente estos dos elementos fueron claves en el encuentroal marcar un gol por lado. El restante lo marcó Alex Fernándezen este duelo correspondientea la novena jornada del torneo Apertura de aquel año.

Mientras todos hablan de Antonio Mohamed, Matías Almeyda, Ariel Holan y Jorge Sampaoli, Fox Sports Radio fue a buscar las declaraciones de Luis Ernesto Pérez, un exRayados que actualmente es entrenador.

“Me han comentado a la distancia pero al final de cuentas yo creo que todavía me falta muchísimo por aprender”, anticipó Lucho antes de que le consultaran por la situación de La Pandilla.

Sin embargo, no pudo escapar a la pregunta del Ruso Brailovsky: “No podría dirigir. Tengo que hacer seis meses de prácticar para terminar con los procesos de UEFA PRO. Es una reglamentación”.

De esta manera, Monterrey tiene una opción menos para reemplazar al uruguayo, aunque no descartó aceptar la propuesta en un futuro: “Siempre ha sido un sueño”.