El inicio de la fase de grupos para Atlético Nacional, en las últimas ocho ediciones, ha sido más que positivo, pues durante varias ediciones de la copa, ha logrado iniciar de la mejor manera a pesar de que en el desarrollo de la misma, sus resultados no continuaran siendo los mejores y lograran clasificar a siguientes fases.
Durante la temporada 2006, Atlético Nacional debutó en aquella edición de la Copa Libertadores frente a Rosario Central de Argentina. En el partido disputado en el Gigante de Arroyito, el ‘Verdolaga’ se impuso 2-1 con goles de Víctor Hugo Aristizabal y Vladimir Marín. En la edición 2008, Nacional empató en territorio brasilero frente a Sao Paulo 1-1- con gol de David Córdoba.
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En el 2012, el equipo verde de Medellín se cruzó contra Universidad de Chile y lo venció 2-0 en el Atanasio Girardot con goles de Juan David Valencia y Dorlan Pabón. En 2014, el rival en el debut en la fase de grupos fue Newell´s Old Boys de Rosario, en aquel año, Nacional se impuso 1-0 en Medellín con gol de Edwin Cardona.
Libertad de Paraguay fue el primer rival de la fase de grupos 2015 de Atlético Nacional, en aquella ocasión, el ‘Verdolaga’ empató 2-2 en territorio paraguayo. En 2016, el año de su último título, su rival fue Huracán de Argentina, aquella vez, Nacional se impuso 2-0 en el Tomás Adolfo Ducó.
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Para la edición 2017, Atlético Nacional sufrió su primera derrota en los debuts en fase de grupos durante sus últimas ocho temperadas, pues Barcelona de Guayaquil lo venció 2-1 en territorio ecuatoriano. Ya en su último debut, fue en el año 2018 frente a Colo Colo de Chile, ganó 1-0 en territorio austral.