En febrero de 2019, Gerardo Bedoya asumió el cargo de director técnico de Independiente Santa Fe tras la salida de Guillermo Sanguinetti. Estuvo en el banquillo hasta final del primer semestre hasta que se anunció la llegada de Patricio Camps.
Al parecer, durante ese tiempo como DT, Santa Fe le habría imcumplido a Bedoya en el pago de su salario. Por esa razón, acudió a mecanismos legales para interponer una demanda a Santa Fe por esta situación.
Ante esta información, Independiente Santa Fe tuvo que publicar un comunicado donde asegurá que toda la plantilla del León se encuentra al dpia con sus pagos, incluso Bedoya. Por esa razón, citaron a Gerardo a una reunión para conciliar la situación.
Juan Andrés Carreño espera el el próximo viernes 26 de julio todo quede arreglado con quien ahora ejerce la función de DT de la categoría Sub-20 en Santa Fe.